办理二类医疗器械注册证，需要按照以下步骤进行：

申请受理。企业向所在地的省、自治区、直辖市人民政府食品药品监督管理部门提交注册申请资料，并提交必要的证明文件。受理部门在受理申请后，将进行初步审查，符合要求的，将予以受理。

审查与核查。在受理申请后，审查部门将对申请资料进行全面的审查，包括资料的真实性、完整性和规范性等。同时，审查部门还将对医疗器械产品进行质量检验和核查，以确保产品的安全性和有效性。

批准与发证。如果审查和核查都通过，国家食品药品监督管理总局将对申请进行批准，并颁发二类医疗器械注册证书。

在办理二类医疗器械注册证的过程中，需要注意以下医疗器械认证条件：

企业应具有相应的许可资格，如医疗器械生产许可证、医疗器械经营许可证等。

企业应建立符合医疗器械质量管理体系要求的质量管理体系文件，并正常运行至少3个月以上。

企业应按照质量管理体系文件要求进行至少一次全面的内部审核，并对发现的问题采取有效的纠正和预防措施。

企业应具备相应的生产能力和质量控制能力，如生产设备、工艺流程、检验设备等。

企业应符合国家有关医疗器械法律法规、标准和技术规范的要求。

以上信息仅供参考，如有疑问建议咨询相关专业人士或机构。